Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2J2Q9GZM3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms