Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms