Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RPAP1Q9BWH6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPAP1Q9BWH6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPAP1Q9BWH6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPAP1Q9BWH6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms