Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms