Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVM2

DPCD, Protein DPCD, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPCDQ9BVM2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DPCDQ9BVM2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DPCDQ9BVM2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DPCDQ9BVM2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DPCDQ9BVM2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DPCDQ9BVM2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DPCDQ9BVM2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DPCDQ9BVM2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DPCDQ9BVM2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DPCDQ9BVM2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DPCDQ9BVM2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DPCDQ9BVM2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DPCDQ9BVM2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DPCDQ9BVM2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DPCDQ9BVM2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DPCDQ9BVM2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DPCDQ9BVM2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DPCDQ9BVM2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms