Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM43Q9BTV4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms