Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCMBPQ9BTE3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms