Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms