Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF25Q9BQ70 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCF25Q9BQ70 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCF25Q9BQ70 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCF25Q9BQ70 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCF25Q9BQ70 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCF25Q9BQ70 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCF25Q9BQ70 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCF25Q9BQ70 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCF25Q9BQ70 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCF25Q9BQ70 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCF25Q9BQ70 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCF25Q9BQ70 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCF25Q9BQ70 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCF25Q9BQ70 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCF25Q9BQ70 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCF25Q9BQ70 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms