Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms