Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms