Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EYA3Q99504 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EYA3Q99504 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms