Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSRNP1Q96S65 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms