Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85AQ96PX6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms