Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP3Q96P20 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP3Q96P20 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms