Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms