Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CELF6Q96J87 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CELF6Q96J87 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms