Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIRT1Q96EB6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms