Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG2BQ96BY7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms