Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.334e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.334e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 FYN-226ENST00000523570 597 ntTSL 56.76□□□□□ -1.334e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 FYN-213ENST00000487824 518 ntTSL 56.76□□□□□ -1.334e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.334e-6■■■■■ 48.1
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TBRG4Q969Z0 MIR4435-2HG-215ENST00000603310 413 ntTSL 1 (best)6.59□□□□□ -1.354e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 ACAP2-210ENST00000475905 759 ntTSL 36.47□□□□□ -1.374e-6■■■■■ 48.1
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TBRG4Q969Z0 CHSY1-205ENST00000561143 819 ntTSL 26.43□□□□□ -1.384e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 USP7-212ENST00000566004 559 ntTSL 46.42□□□□□ -1.384e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.384e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 HDAC3-209ENST00000486618 711 ntTSL 36.41□□□□□ -1.384e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.44e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 FYN-228ENST00000524310 541 ntTSL 46.21□□□□□ -1.424e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 USP7-207ENST00000563085 3194 ntTSL 26.17□□□□□ -1.424e-6■■■■■ 48.1
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TBRG4Q969Z0 PTP4A2-202ENST00000468531 830 ntTSL 36□□□□□ -1.454e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.464e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.464e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CNPY2-212ENST00000553191 621 ntTSL 25.92□□□□□ -1.464e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 LEF1-205ENST00000504426 1479 ntTSL 35.87□□□□□ -1.474e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CNPY2-203ENST00000546466 673 ntTSL 35.82□□□□□ -1.484e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 STK39-203ENST00000487143 2214 ntTSL 1 (best)5.78□□□□□ -1.484e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.54e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 BRD2-207ENST00000463639 946 ntTSL 25.71□□□□□ -1.54e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 LEF1-215ENST00000510135 1376 ntTSL 25.66□□□□□ -1.54e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 FYN-223ENST00000521361 723 ntTSL 45.49□□□□□ -1.534e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 LEF1-204ENST00000503879 1492 ntTSL 35.2□□□□□ -1.584e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.594e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 USP7-219ENST00000569230 569 ntTSL 55.11□□□□□ -1.594e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 AFTPH-206ENST00000487769 793 ntTSL 54.94□□□□□ -1.624e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 SLC37A3-225ENST00000492027 551 ntTSL 44.79□□□□□ -1.644e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 AFTPH-203ENST00000409183 1874 ntTSL 24.72□□□□□ -1.654e-6■■■■■ 48.1
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TBRG4Q969Z0 CEP170-201ENST00000336415 5961 ntTSL 53.64□□□□□ -1.834e-6■■■■■ 48.1
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TBRG4Q969Z0 ACACA-243ENST00000618575 772 ntTSL 42.43□□□□□ -2.024e-6■■■■■ 48.1
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TBRG4Q969Z0 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.057e-7■■■■■ 48.1
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TBRG4Q969Z0 NAP1L4-204ENST00000448187 888 ntTSL 53.82□□□□□ -1.82e-6■■■■■ 48.1
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TBRG4Q969Z0 SPTLC1-202ENST00000337841 946 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 47.9
TBRG4Q969Z0 SPTLC1-206ENST00000482632 837 ntTSL 59.87□□□□□ -0.832e-6■■■■■ 47.9
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TBRG4Q969Z0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 47.7
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TBRG4Q969Z0 HNRNPD-212ENST00000515432 545 ntTSL 56.77□□□□□ -1.331e-6■■■■■ 47.7
TBRG4Q969Z0 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.393e-10■■■■■ 47.7
TBRG4Q969Z0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.791e-6■■■■■ 47.4
TBRG4Q969Z0 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 47.4
TBRG4Q969Z0 CDK5RAP2-201ENST00000349780 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.483e-6■■■■■ 47.4
TBRG4Q969Z0 CDK5RAP2-203ENST00000360822 5551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.753e-6■■■■■ 47.4
TBRG4Q969Z0 CFDP1-201ENST00000283882 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 47.2
TBRG4Q969Z0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.663e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 CTCF-203ENST00000566078 1627 ntTSL 230.44■■■□□ 2.463e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 NR4A1-207ENST00000546842 1258 ntTSL 227.81■■■□□ 2.049e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.743e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.376e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.32e-8■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.16e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.076e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 UBE2J2-209ENST00000461142 837 ntTSL 321.53■■□□□ 1.046e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.033e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.016e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.913e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.893e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 PIK3CD-204ENST00000481137 386 ntTSL 220.49■□□□□ 0.873e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 VPS72-202ENST00000368892 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)20.36■□□□□ 0.853e-10■■■■■ 47.1
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