Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKL1Q969V6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms