Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNPO1Q92973 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNPO1Q92973 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms