Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCC1Q92922 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCC1Q92922 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms