Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNRQ92752 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNRQ92752 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNRQ92752 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNRQ92752 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNRQ92752 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNRQ92752 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNRQ92752 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TNRQ92752 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TNRQ92752 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNRQ92752 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TNRQ92752 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TNRQ92752 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNRQ92752 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNRQ92752 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNRQ92752 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNRQ92752 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNRQ92752 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNRQ92752 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNRQ92752 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNRQ92752 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNRQ92752 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNRQ92752 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TNRQ92752 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNRQ92752 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TNRQ92752 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNRQ92752 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNRQ92752 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TNRQ92752 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNRQ92752 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNRQ92752 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNRQ92752 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNRQ92752 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNRQ92752 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TNRQ92752 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNRQ92752 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNRQ92752 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNRQ92752 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNRQ92752 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNRQ92752 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNRQ92752 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNRQ92752 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNRQ92752 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNRQ92752 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNRQ92752 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TNRQ92752 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNRQ92752 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNRQ92752 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNRQ92752 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TNRQ92752 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TNRQ92752 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNRQ92752 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNRQ92752 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNRQ92752 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TNRQ92752 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNRQ92752 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TNRQ92752 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TNRQ92752 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNRQ92752 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNRQ92752 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNRQ92752 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNRQ92752 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNRQ92752 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNRQ92752 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNRQ92752 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNRQ92752 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TNRQ92752 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNRQ92752 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNRQ92752 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNRQ92752 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNRQ92752 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TNRQ92752 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNRQ92752 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNRQ92752 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNRQ92752 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNRQ92752 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNRQ92752 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNRQ92752 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNRQ92752 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNRQ92752 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNRQ92752 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNRQ92752 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TNRQ92752 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNRQ92752 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TNRQ92752 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TNRQ92752 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNRQ92752 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNRQ92752 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNRQ92752 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TNRQ92752 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNRQ92752 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNRQ92752 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNRQ92752 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNRQ92752 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNRQ92752 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNRQ92752 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNRQ92752 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNRQ92752 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNRQ92752 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNRQ92752 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms