Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PHF3Q92576 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms