Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ96

CMTM1, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1Q8IZ96 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMTM1Q8IZ96 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms