Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms