Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC149Q6ZUS6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC149Q6ZUS6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC149Q6ZUS6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC149Q6ZUS6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms