Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNE3Q6ZMZ3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNE3Q6ZMZ3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNE3Q6ZMZ3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNE3Q6ZMZ3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNE3Q6ZMZ3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNE3Q6ZMZ3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNE3Q6ZMZ3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNE3Q6ZMZ3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNE3Q6ZMZ3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNE3Q6ZMZ3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNE3Q6ZMZ3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNE3Q6ZMZ3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNE3Q6ZMZ3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNE3Q6ZMZ3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNE3Q6ZMZ3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNE3Q6ZMZ3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms