Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIM72Q6ZMU5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM72Q6ZMU5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms