Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FOXD4L3Q6VB84 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms