Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTR9Q6PD62 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTR9Q6PD62 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms