Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGMBQ6NW40 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RGMBQ6NW40 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms