Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USPL1Q5W0Q7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms