Protein–RNA interactions for Protein: Q5T200

ZC3H13, Zinc finger CCCH domain-containing protein 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H13Q5T200 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZC3H13Q5T200 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZC3H13Q5T200 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZC3H13Q5T200 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZC3H13Q5T200 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZC3H13Q5T200 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZC3H13Q5T200 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZC3H13Q5T200 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZC3H13Q5T200 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ZC3H13Q5T200 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZC3H13Q5T200 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZC3H13Q5T200 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZC3H13Q5T200 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZC3H13Q5T200 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZC3H13Q5T200 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZC3H13Q5T200 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZC3H13Q5T200 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZC3H13Q5T200 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ZC3H13Q5T200 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ZC3H13Q5T200 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZC3H13Q5T200 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZC3H13Q5T200 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZC3H13Q5T200 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZC3H13Q5T200 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZC3H13Q5T200 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZC3H13Q5T200 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZC3H13Q5T200 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZC3H13Q5T200 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZC3H13Q5T200 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZC3H13Q5T200 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ZC3H13Q5T200 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZC3H13Q5T200 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZC3H13Q5T200 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZC3H13Q5T200 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZC3H13Q5T200 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ZC3H13Q5T200 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms