Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
WDR44Q5JSH3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms