Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms