Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALFQ53S48 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALFQ53S48 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALFQ53S48 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALFQ53S48 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALFQ53S48 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALFQ53S48 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALFQ53S48 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALFQ53S48 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALFQ53S48 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALFQ53S48 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALFQ53S48 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALFQ53S48 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALFQ53S48 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALFQ53S48 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms