Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ANKRD39Q53RE8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms