Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDCA8Q53HL2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDCA8Q53HL2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDCA8Q53HL2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CDCA8Q53HL2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms