Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SVEP1Q4LDE5 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms