Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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KRTAP21-3Q3LHN1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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KRTAP21-3Q3LHN1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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KRTAP21-3Q3LHN1 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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