Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NBPF8Q3BBV2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF8Q3BBV2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms