Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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NDUFA9Q16795 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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NDUFA9Q16795 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
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NDUFA9Q16795 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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NDUFA9Q16795 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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NDUFA9Q16795 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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NDUFA9Q16795 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NDUFA9Q16795 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NDUFA9Q16795 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFA9Q16795 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFA9Q16795 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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NDUFA9Q16795 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFA9Q16795 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFA9Q16795 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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NDUFA9Q16795 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFA9Q16795 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFA9Q16795 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFA9Q16795 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFA9Q16795 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFA9Q16795 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFA9Q16795 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFA9Q16795 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFA9Q16795 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFA9Q16795 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFA9Q16795 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFA9Q16795 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFA9Q16795 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFA9Q16795 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFA9Q16795 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFA9Q16795 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFA9Q16795 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFA9Q16795 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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