Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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