Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDSNQ15517 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms