Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A1Q15459 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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