Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTF1Q15361 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
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