Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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