Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
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CHD4Q14839 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
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CHD4Q14839 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
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CHD4Q14839 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
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CHD4Q14839 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
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CHD4Q14839 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHD4Q14839 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
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CHD4Q14839 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
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CHD4Q14839 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
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